Data Engineer / Platform Engineer (Kubernetes, pipelines)

Компания ООО «Онкодиагностика Атлас» (Центр молекулярной онкологии «ОнкоАтлас»)

ОнкоАтлас - лидирующая компания на рынке прецизионной онкологии. Мы помогаем больным, подбирая лучшее лечение по результатам молекулярного профилирования опухоли. Наша цель - сделать прецизионную онкологию доступной максимальному количеству людей.

В 2020 мы зарегистрировали первый в России набор реагентов для генетического анализа мутаций генов BRCA1/BRCA2 и других методом NGS, в 2021 – набор для анализа 15 генов для диагностики рака легкого, меланомы, колоректального рака и некоторых иных типов рака, а также развиваем широкий спектр услуг персонализированного генетического анализа в онкологии. Дальше - больше. В рамках любой деятельности мы придерживаемся высоких стандартов качества и, помимо разработки и реализации диагностических тест-систем на основе NGS, мы выполняем услуги по комплексному молекулярному профилированию, а также на постоянной основе инициируем или участвуем в научно-исследовательских проектах в сфере трансляционной онкологии.

О позиции:

Ищем специалиста для создания и поддержки пайплайнов по анализу генетических данных, адаптации текущей инфраструктуры для новых задач. Опыт в биоинформатике приветствуется, но не обязателен. Ключевым является опыт работы с большими объёмами данных и вычислений.

Обязанности:

• проектирование и развитие пайплайнов обработки данных;
• интеграция пайплайнов с Kubernetes;
• работа с workflow-движками (Nextflow или аналоги);
• оптимизация использования ресурсов кластера;
• интеграция с существующей инфраструктурой (Redis, GitLab, ArgoCD).

Требования (must-have):

• опыт работы c Kubernetes, Docker, Git;
• опыт построения или эксплуатации data pipelines;
• опыт программирования или автоматизации (Python, Bash или аналогичные);
• понимание GitOps-подхода.

Будет плюсом:

• опыт с Nextflow / Airflow / Luigi / Argo Workflows;
• знание Python и MySQL;
• опыт работы с высоконагруженными batch-задачами;
• понимание принципов хранения и версионирования результатов вычислений.

Мы предлагаем:

• официальное трудоустройство по Трудовому кодексу;

• пятидневная рабочая неделя (пн-пт);

• ДМС после испытательного срока (3 месяца);

• формат работы обсуждаем (гибридный/удаленный), офис в шаговой доступности от м.Октябрьская;

• прозрачная система премирования